Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme6O88425 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme6O88425 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms