Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3BO75182 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms