Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ldb2O55203 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ldb2O55203 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ldb2O55203 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ldb2O55203 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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