Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms