Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Notch2O35516 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Notch2O35516 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms