Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp955bL7N232 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp955bL7N232 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms