Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5458L7N219 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5458L7N219 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms