Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21900J3QP38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm21900J3QP38 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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