Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Zfp616J3QN14 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp616J3QN14 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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