Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21411J3KMS0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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