Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20708H3BKF4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20708H3BKF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms