Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms