Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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