Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf4bG5E8Z2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4bG5E8Z2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4bG5E8Z2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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