Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17lcG5E8I7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lcG5E8I7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms