Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r58G3X9U3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms