Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8005F6YKY3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8005F6YKY3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms