Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8220F6YKI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms