Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5218F6YH22 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5218F6YH22 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5218F6YH22 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5218F6YH22 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5218F6YH22 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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