Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cald1E9QA15 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cald1E9QA15 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cald1E9QA15 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms