Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f1E9Q9P8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f1E9Q9P8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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