Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930579F01RikE9Q3L6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms