Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb3D3Z6J4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms