Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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AU015836B2RUM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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AU015836B2RUM3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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AU015836B2RUM3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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AU015836B2RUM3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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AU015836B2RUM3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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AU015836B2RUM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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AU015836B2RUM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms