Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apol7aB2RT54 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Apol7aB2RT54 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol7aB2RT54 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms