Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm438B1ASB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm438B1ASB3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm438B1ASB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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