Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc9bA3KGF9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms