Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef17A2ASJ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef17A2ASJ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms