Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FocadA2AKG8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms