Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn6A2AJB9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Lcn6A2AJB9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Lcn6A2AJB9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn6A2AJB9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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