Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkd2l1A2A259 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms