Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc173A0JLY1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms