Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms