Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RNP2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms