Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5493S4R2D1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms