Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dctn3Q9Z0Y1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms