Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC4Q9Y296 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms