Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnip1Q9WUU8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnip1Q9WUU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms