Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr4Q9WUF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr4Q9WUF2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms