Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf13bQ9WU72 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf13bQ9WU72 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms