Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubd1Q9R1K7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubd1Q9R1K7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms