Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htra1Q9R118 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra1Q9R118 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms