Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ripk3Q9QZL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk3Q9QZL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms