Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ercc4Q9QZD4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms