Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx4Q9QY61 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx4Q9QY61 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx4Q9QY61 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.5 ms