Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nphp1Q9QY53 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp1Q9QY53 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms