Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChmQ9QXG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmQ9QXG2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms