Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phc2Q9QWH1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phc2Q9QWH1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms