Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mid2Q9QUS6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms