Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx5Q9JKQ4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms