Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl39Q9JKF7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms